Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA4Q16363 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms