Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CDSNQ15517 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CDSNQ15517 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDSNQ15517 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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