Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP1Q15431 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP1Q15431 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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