Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RYR3Q15413 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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