Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HDM1Q15032 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
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