Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GBX1Q14549 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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GBX1Q14549 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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GBX1Q14549 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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GBX1Q14549 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GBX1Q14549 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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