Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN1Q14457 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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