Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
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