Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDK13Q14004 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDK13Q14004 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDK13Q14004 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
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