Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB1Q13884 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB1Q13884 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms