Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C1orf61Q13536 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
C1orf61Q13536 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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