Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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