Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNTB2Q13425 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTB2Q13425 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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