Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAPPAQ13219 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPPAQ13219 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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