Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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