Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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