Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFX1Q12986 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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