Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXF1Q12946 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF1Q12946 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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