Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC10A2Q12908 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC10A2Q12908 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms