Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
GRIN2AQ12879 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
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GRIN2AQ12879 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
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GRIN2AQ12879 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2AQ12879 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
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