Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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KCNMA1Q12791 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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KCNMA1Q12791 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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KCNMA1Q12791 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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KCNMA1Q12791 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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KCNMA1Q12791 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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KCNMA1Q12791 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMA1Q12791 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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