Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 HDA3YPR179C 1968 nt1.39□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 IRR1YIL026C 3453 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 EFR3YMR212C 2349 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 RTR1YER139C 681 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 PRE4YFR050C 801 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 RPS20YHL015W 366 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 MCM22YJR135C 720 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 COA6YMR244C-A 315 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 SAR1YPL218W 573 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YCL046WYCL046W 324 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 SPC110YDR356W 2835 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 FRK1YPL141C 2598 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 OSH6YKR003W 1347 nt1.38□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 DCP2YNL118C 2913 nt1.37□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 POL5YEL055C 3069 nt1.37□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 SEY1YOR165W 2331 nt1.37□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 PAU18YLL064C 363 nt1.37□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 PAU6YNR076W 363 nt1.37□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 REV3YPL167C 4515 nt1.37□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YGR250CYGR250C 2346 nt1.37□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 PXA2YKL188C 2562 nt1.36□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.36□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YBR174CYBR174C 315 nt1.36□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 MAK10YEL053C 2202 nt1.36□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 CTR9YOL145C 3234 nt1.36□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 HIR3YJR140C 4947 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 MEC1YBR136W 7107 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 RPL31AYDL075W 342 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YGR265WYGR265W 411 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YHL041WYHL041W 450 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 TRX1YLR043C 312 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 CCH1YGR217W 6120 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 PAC1YOR269W 1485 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 ZRG17YNR039C 1818 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 PET127YOR017W 2403 nt1.35□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 NOP53YPL146C 1368 nt1.34□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.34□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.34□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.34□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 MSC6YOR354C 2079 nt1.34□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 HMI1YOL095C 2121 nt1.34□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 BRR2YER172C 6492 nt1.34□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 ZIP1YDR285W 2628 nt1.33□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 CYC7YEL039C 342 nt1.33□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 SGO1YOR073W 1773 nt1.33□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 RLM1YPL089C 2031 nt1.33□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 SXM1YDR395W 2835 nt1.33□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YOR019WYOR019W 2193 nt1.32□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.32□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 SLY1YDR189W 2001 nt1.32□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 LYS14YDR034C 2373 nt1.32□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YEL057CYEL057C 702 nt1.32□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 ABM1YJR108W 372 nt1.32□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 RFX1YLR176C 2436 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 TDA9YML081W 3756 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 UPS1YLR193C 528 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YOP1YPR028W 543 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 NUT2YPR168W 474 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 ATG11YPR049C 3537 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 SKI3YPR189W 4299 nt1.31□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 CTF4YPR135W 2784 nt1.3□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YIL102CYIL102C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 TIM18YOR297C 579 nt1.3□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 MUK1YPL070W 1839 nt1.3□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 SAC3YDR159W 3906 nt1.3□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 HKR1YDR420W 5409 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 MSH5YDL154W 2706 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 PFD1YJL179W 330 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 MRPL31YKL138C 396 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 RPL40BYKR094C 387 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YAF9YNL107W 681 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 PIK1YNL267W 3201 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 FYV8YGR196C 2454 nt1.29□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 MLH3YPL164C 2148 nt1.28□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 SRP14YDL092W 441 nt1.28□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 CSN9YDR179C 489 nt1.28□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YKL136WYKL136W 399 nt1.28□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.28□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 RPB10YOR210W 213 nt1.28□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 MDM20YOL076W 2391 nt1.28□□□□□ -2.2
TIR4Q12218 RIM20YOR275C 1986 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 YHL037CYHL037C 402 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 RPL38YLR325C 237 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 YPL225WYPL225W 441 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 SPO24YPR036W-A 204 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 snR51snR51 107 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 YLL032CYLL032C 2478 nt1.27□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 YDR102CYDR102C 333 nt1.26□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 YJR011CYJR011C 786 nt1.26□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 SAS3YBL052C 2496 nt1.26□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 YLR419WYLR419W 4308 nt1.25□□□□□ -2.21
TIR4Q12218 RPL35AYDL191W 363 nt1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.9 ms