Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 snR84snR84 550 nt0.94□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YFL012WYFL012W 447 nt0.94□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.94□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.94□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.94□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 LYS14YDR034C 2373 nt0.94□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 SWI6YLR182W 2412 nt0.94□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 TMA22YJR014W 597 nt0.93□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 HIT1YJR055W 495 nt0.93□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.93□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 NUT2YPR168W 474 nt0.93□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 IFH1YLR223C 3258 nt0.92□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 OCA6YDR067C 675 nt0.92□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.92□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YGR045CYGR045C 363 nt0.92□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YJR141WYJR141W 1044 nt0.92□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YBR012CYBR012C 420 nt0.92□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 SIP4YJL089W 2490 nt0.92□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 MET32YDR253C 576 nt0.91□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 APQ13YJL075C 417 nt0.91□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 IML1YJR138W 4755 nt0.91□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.9□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.9□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 CDC39YCR093W 6327 nt0.9□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 KAP120YPL125W 3099 nt0.9□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 SCW11YGL028C 1629 nt0.89□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 SDH2YLL041C 801 nt0.89□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YPR117WYPR117W 7470 nt0.89□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 SAS3YBL052C 2496 nt0.88□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YDL016CYDL016C 303 nt0.88□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 RUF22RUF22 515 nt0.88□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 PXA2YKL188C 2562 nt0.87□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 RPL16AYIL133C 600 nt0.87□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YKL123WYKL123W 381 nt0.87□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 UBX4YMR067C 1251 nt0.87□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 IRC23YOR044W 474 nt0.87□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.87□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.87□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 snR13snR13 124 nt0.86□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 SET3YKR029C 2256 nt0.86□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 SNU56YDR240C 1479 nt0.86□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 CYC7YEL039C 342 nt0.85□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 HUR1YGL168W 333 nt0.85□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YGR025WYGR025W 303 nt0.85□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YLL032CYLL032C 2478 nt0.85□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 UPS1YLR193C 528 nt0.85□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 RIM20YOR275C 1986 nt0.85□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 FIG4YNL325C 2640 nt0.85□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 APL2YKL135C 2181 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 AIM9YER080W 1884 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 RFX1YLR176C 2436 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YDR029WYDR029W 315 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 MXR1YER042W 555 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YGL239CYGL239C 315 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 ERP4YOR016C 624 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 RCN2YOR220W 798 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 PAU24YBR301W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 NUP157YER105C 4176 nt0.84□□□□□ -2.27
MSH5Q12175 ENV11YGR071C 2583 nt0.84□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 ALY2YJL084C 3141 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 SLY1YDR189W 2001 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YAP3YHL009C 993 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YIL059CYIL059C 366 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 RPL32YBL092W 393 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 TSC3YBR058C-A 243 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 MMS4YBR098W 2076 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 PDE2YOR360C 1581 nt0.83□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 STO1YMR125W 2586 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 RTT102YGR275W 474 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 MRPL31YKL138C 396 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YDL206WYDL206W 2289 nt0.82□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 NBL1YHR199C-A 222 nt0.81□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YOR199WYOR199W 330 nt0.81□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 LCD1YDR499W 2244 nt0.81□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.8□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YER135CYER135C 393 nt0.8□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 RRT1YBL048W 312 nt0.8□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YDR269CYDR269C 324 nt0.79□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 BIG1YHR101C 1008 nt0.79□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 HCH1YNL281W 462 nt0.79□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 SLI15YBR156C 2097 nt0.78□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 RPL9AYGL147C 576 nt0.78□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.78□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 PHS1YJL097W 654 nt0.78□□□□□ -2.28
MSH5Q12175 URM1YIL008W 300 nt0.77□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 GPI15YNL038W 690 nt0.77□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 UBP3YER151C 2739 nt0.76□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 EFR3YMR212C 2349 nt0.76□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 NPC2YDL046W 522 nt0.76□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 RPS27AYKL156W 249 nt0.76□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 YPL182CYPL182C 384 nt0.76□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 SLD3YGL113W 2007 nt0.76□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 TTI1YKL033W 3117 nt0.75□□□□□ -2.29
MSH5Q12175 YCR001WYCR001W 315 nt0.74□□□□□ -2.29
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