Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC15Q0P6D6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms