Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms