Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms