Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms