Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms