Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHHADHQ08426 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHHADHQ08426 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms