Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDR1Q08345 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDR1Q08345 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms