Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TGM3Q08188 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms