Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LRP1Q07954 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms