Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
SCN1BQ07699 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN1BQ07699 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms