Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK18Q07002 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK18Q07002 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms