Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PAX8Q06710 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms