Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 ECM21YBL101C 3354 nt3.11□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 RRP6YOR001W 2202 nt3.1□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 PMP2YEL017C-A 132 nt3.1□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.1□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 SNC1YAL030W 354 nt3.1□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 FIR1YER032W 2631 nt3.1□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 SMY2YBR172C 2223 nt3.09□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 DYN1YKR054C 12279 nt3.09□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 PUT3YKL015W 2940 nt3.09□□□□□ -1.91
HDA3Q06623 AIM44YPL158C 2277 nt3.09□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 INP53YOR109W 3324 nt3.09□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 STE6YKL209C 3873 nt3.09□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 RPA190YOR341W 4995 nt3.09□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 RCY1YJL204C 2523 nt3.09□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 SET2YJL168C 2202 nt3.08□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 RIF1YBR275C 5751 nt3.08□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PHD1YKL043W 1101 nt3.08□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt3.08□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 SIN3YOL004W 4611 nt3.08□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PRP8YHR165C 7242 nt3.08□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 SPO14YKR031C 5052 nt3.08□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PAU3YCR104W 375 nt3.07□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.07□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 MGM1YOR211C 2646 nt3.07□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 RLM1YPL089C 2031 nt3.07□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 YER053C-AYER053C-A 114 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 SBH1YER087C-B 249 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 TFC4YGR047C 3078 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 RPN1YHR027C 2982 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PAU8YAL068C 363 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PAU18YLL064C 363 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 ZRG17YNR039C 1818 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PAU6YNR076W 363 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PAU20YOL161C 363 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 YBR099CYBR099C 384 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 SPO71YDR104C 3738 nt3.06□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 NMD2YHR077C 3270 nt3.05□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 CDC53YDL132W 2448 nt3.05□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.04□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt3.04□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 snR61snR61 90 nt3.03□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 RPO41YFL036W 4056 nt3.03□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 SSN2YDR443C 4263 nt3.03□□□□□ -1.92
HDA3Q06623 PIP2YOR363C 2991 nt3.03□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 NFT1YKR103W 3657 nt3.03□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YGR067CYGR067C 2415 nt3.02□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 RAD34YDR314C 2079 nt3.02□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YOR296WYOR296W 3870 nt3.02□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 ATG11YPR049C 3537 nt3.02□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 VTC3YPL019C 2508 nt3.02□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 POL3YDL102W 3294 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 ATP7YKL016C 525 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YPL044CYPL044C 549 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 SKP2YNL311C 2292 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 NAM7YMR080C 2916 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 VMR1YHL035C 4779 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 ZIP2YGL249W 2115 nt3.01□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 APL5YPL195W 2799 nt3□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 NOC3YLR002C 1992 nt3□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 PBY1YBR094W 2262 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 INP51YIL002C 2841 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 CTF4YPR135W 2784 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YME2YMR302C 2553 nt2.99□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 SAS3YBL052C 2496 nt2.98□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 SWR1YDR334W 4545 nt2.98□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YCL046WYCL046W 324 nt2.98□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 MSB2YGR014W 3921 nt2.98□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 KAP104YBR017C 2757 nt2.97□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 EDS1YBR033W 2760 nt2.97□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 AHC1YOR023C 1701 nt2.97□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.97□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.97□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 FLO1YAR050W 4614 nt2.97□□□□□ -1.93
HDA3Q06623 CBF2YGR140W 2871 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 MET6YER091C 2304 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 YLR282CYLR282C 342 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 MAD1YGL086W 2250 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 TOM1YDR457W 9807 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 SBE22YHR103W 2559 nt2.96□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 ZIP1YDR285W 2628 nt2.95□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 SLD3YGL113W 2007 nt2.95□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 HOS4YIL112W 3252 nt2.95□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 PAA1YDR071C 576 nt2.95□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 DBP10YDL031W 2988 nt2.95□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 FRE2YKL220C 2136 nt2.95□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 BPT1YLL015W 4680 nt2.95□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 PMR1YGL167C 2853 nt2.94□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 RPL31AYDL075W 342 nt2.94□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 PTP2YOR208W 2253 nt2.94□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 DCP2YNL118C 2913 nt2.93□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 YNL211CYNL211C 261 nt2.93□□□□□ -1.94
HDA3Q06623 CAT2YML042W 2013 nt2.93□□□□□ -1.94
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