Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABPAQ06546 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms