Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 EMC4YGL231C 573 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 YLL020CYLL020C 306 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.92□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 PIG1YLR273C 1947 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 LYS14YDR034C 2373 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 MXR1YER042W 555 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 RPL9BYNL067W 576 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 snR14snR14 160 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 PIP2YOR363C 2991 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG39Q06159 BIG1YHR101C 1008 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 STE18YJR086W 333 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 GPI15YNL038W 690 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 SEC3YER008C 4011 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 SIP4YJL089W 2490 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YDR114CYDR114C 303 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 EAF6YJR082C 342 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 RPL32YBL092W 393 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 TSC3YBR058C-A 243 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 PXA2YKL188C 2562 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 SPT21YMR179W 2277 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 NOC3YLR002C 1992 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 BEM2YER155C 6504 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 ROM2YLR371W 4071 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YGL239CYGL239C 315 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 RTT102YGR275W 474 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 CLU1YMR012W 3834 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 EAF1YDR359C 2949 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 APL3YBL037W 3078 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YCR001WYCR001W 315 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YDL158CYDL158C 309 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 PBI2YNL015W 228 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 NUT2YPR168W 474 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 STB6YKL072W 2301 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 DOP1YDR141C 5097 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 URM1YIL008W 300 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 SWI6YLR182W 2412 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 ENV11YGR071C 2583 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 NUP145YGL092W 3954 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 NBL1YHR199C-A 222 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YLR269CYLR269C 351 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 RUF22RUF22 515 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 CDC39YCR093W 6327 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 IFH1YLR223C 3258 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 TTI1YKL033W 3117 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YGR045CYGR045C 363 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 YPR153WYPR153W 423 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG39Q06159 MPT5YGL178W 2580 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 BUD3YCL014W 4911 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 SMC1YFL008W 3678 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 RPF1YHR088W 888 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YBR012CYBR012C 420 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YLL032CYLL032C 2478 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 APL2YKL135C 2181 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 RFX1YLR176C 2436 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 RPL16AYIL133C 600 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 PHS1YJL097W 654 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 NFU1YKL040C 771 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 SCW11YGL028C 1629 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 MRPL31YKL138C 396 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YML108WYML108W 318 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 SAS3YBL052C 2496 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YDR269CYDR269C 324 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YIL059CYIL059C 366 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 SDH2YLL041C 801 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 UPS1YLR193C 528 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 HCH1YNL281W 462 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YPL182CYPL182C 384 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 ALY2YJL084C 3141 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 SET3YKR029C 2256 nt0.8□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 YHR125WYHR125W 306 nt0.79□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 SLY1YDR189W 2001 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 AIM29YKR074W 468 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 AIM44YPL158C 2277 nt0.78□□□□□ -2.28
ATG39Q06159 NUP157YER105C 4176 nt0.78□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YHR130CYHR130C 336 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 IRC23YOR044W 474 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 KAP120YPL125W 3099 nt0.77□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 LCD1YDR499W 2244 nt0.76□□□□□ -2.29
ATG39Q06159 CYC7YEL039C 342 nt0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms