Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KDSRQ06136 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 558.7 ms