Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 YIL102CYIL102C 306 nt1.43□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 ABM1YJR108W 372 nt1.43□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YML003WYML003W 873 nt1.43□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 BPH1YCR032W 6504 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 PRE4YFR050C 801 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YIL059CYIL059C 366 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 PFD1YJL179W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YLR255CYLR255C 354 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YOR029WYOR029W 336 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YPL261CYPL261C 309 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 PXA2YKL188C 2562 nt1.42□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 CCH1YGR217W 6120 nt1.41□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.41□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.41□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 SAR1YPL218W 573 nt1.41□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 SLY1YDR189W 2001 nt1.4□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 TDA9YML081W 3756 nt1.4□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.4□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 ATG31YDR022C 591 nt1.4□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YEL057CYEL057C 702 nt1.4□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 RTR1YER139C 681 nt1.4□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.4□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 LYS14YDR034C 2373 nt1.4□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 PET127YOR017W 2403 nt1.39□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YJR003CYJR003C 1560 nt1.39□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 SBE22YHR103W 2559 nt1.39□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 MDM20YOL076W 2391 nt1.39□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.39□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YOP1YPR028W 543 nt1.39□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 MLH3YPL164C 2148 nt1.39□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 MSH5YDL154W 2706 nt1.38□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 BRR2YER172C 6492 nt1.38□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 CYC7YEL039C 342 nt1.38□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 IRC23YOR044W 474 nt1.38□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 RFX1YLR176C 2436 nt1.38□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 FYV8YGR196C 2454 nt1.38□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 CAT8YMR280C 4302 nt1.37□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 GIM4YEL003W 336 nt1.37□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YHL041WYHL041W 450 nt1.37□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 TRX1YLR043C 312 nt1.37□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 CHS1YNL192W 3396 nt1.37□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 SFB2YNL049C 2631 nt1.36□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 SRP14YDL092W 441 nt1.36□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 ATP6Q0085 780 nt1.36□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YGR035CYGR035C 351 nt1.36□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YBR012CYBR012C 420 nt1.36□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 PIK1YNL267W 3201 nt1.36□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 MEC1YBR136W 7107 nt1.35□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 CTF4YPR135W 2784 nt1.35□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 RPL31AYDL075W 342 nt1.35□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YAR053WYAR053W 297 nt1.35□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 YNL058CYNL058C 951 nt1.35□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 DGR2YKL121W 2559 nt1.35□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 SKI3YPR189W 4299 nt1.35□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 SAS3YBL052C 2496 nt1.34□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 MUK1YPL070W 1839 nt1.34□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 MRPL31YKL138C 396 nt1.34□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 NUT2YPR168W 474 nt1.34□□□□□ -2.19
YHC1Q05900 SAC3YDR159W 3906 nt1.34□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 SEC5YDR166C 2916 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 IRA1YBR140C 9279 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 PAC1YOR269W 1485 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 UPS1YLR193C 528 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 RPB10YOR210W 213 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 CDC31YOR257W 486 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 BIL1YOR304C-A 231 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YLL032CYLL032C 2478 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 SSK2YNR031C 4740 nt1.33□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 CDC25YLR310C 4770 nt1.32□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YHL037CYHL037C 402 nt1.32□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.32□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YOR019WYOR019W 2193 nt1.32□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YLR419WYLR419W 4308 nt1.32□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 PAU2YEL049W 363 nt1.31□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YPR197CYPR197C 564 nt1.31□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 snR51snR51 107 nt1.31□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 SPC110YDR356W 2835 nt1.31□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 MON2YNL297C 4911 nt1.31□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 POL5YEL055C 3069 nt1.3□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.3□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 SGO1YOR073W 1773 nt1.29□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 EMC5YIL027C 426 nt1.29□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 SDH2YLL041C 801 nt1.29□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.29□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 SPO24YPR036W-A 204 nt1.29□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.29□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 PIG1YLR273C 1947 nt1.28□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 RAD50YNL250W 3939 nt1.28□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.28□□□□□ -2.2
YHC1Q05900 RIM20YOR275C 1986 nt1.27□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 COF1YLL050C 432 nt1.27□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.27□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 SXM1YDR395W 2835 nt1.27□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 INP2YMR163C 2118 nt1.27□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 REV3YPL167C 4515 nt1.27□□□□□ -2.21
YHC1Q05900 NCA2YPR155C 1851 nt1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms