Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms