Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL10A1Q03692 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL10A1Q03692 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL10A1Q03692 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL10A1Q03692 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COL10A1Q03692 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms