Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARDQ03181 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms