Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN2Q02246 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN2Q02246 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms