Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF17Q02223 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms