Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDR2Q01850 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms