Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPCQ01831 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPCQ01831 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPCQ01831 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPCQ01831 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPCQ01831 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPCQ01831 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XPCQ01831 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XPCQ01831 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XPCQ01831 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XPCQ01831 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XPCQ01831 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms