Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MC1RQ01726 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MC1RQ01726 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms