Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IFITM3Q01628 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IFITM3Q01628 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms