Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA6Q01524 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms